
После того, как вы его скачали по выше приведенной ссылке, нужно зайти в сам менеджер, в Plugins - > Manage plugins - > Install plugin и выбираем скачанный нами файл. После этого он должен появиться в вкладке Plugins, где его и можно найти или же вызвать комбинацией клавиш Ctrl-Alt-R. В настройках можно прописать, как душа хочет, чтобы выглядело название статьи, например, вот так [auth], [year]-[title]. Можно переименовывать как все файлы (к ним должны быть ссылки в программе), так и отдельные файлы.
P.S. Если вы работает в связке JabRef-Docear, то полезно будет в самом менеджере вписывать XMP-данные статьи (все это делается через меню Tools) в pdf-файл: когда вы будете делать мозговую карту в Docear и вам нужно будет прикрепить к ней статью, то сие весьма сильно облегчит вам жизнь (не надо будет вручную вписывать авторов и название сттьи в встроенный менеджер библиографии в Docear)